SMK Muhammadiyah Serui merupakan salah satu Amal Usaha Muhammadiyah dengan Nomor SK. Pendirian 421.3/696/2002 pada tanggal 23 April 2004 dengan Nomor SK. Operasional 422.1/747/2007 pada tanggal 05 Juni 2007.

SMK Muhammadiyah Serui berada dibawah naungan Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan yang beralamat di Jl. Kamboja RT-05 RW-04 Kelurahan Serui Kota Kecamatan Yapen Selatan Kabupaten Kepulauan Yapen Provinsi Papua.